2020年之前（原帖）2018年07月2018-07-22 俯卧撑100 引体202018-07-23 俯卧撑110 引体向上302018-07-24 100俯卧撑35引体2018-07-25 100俯卧撑35引体向上2018-07-27 40引体向上2018-07-28 4
LA reads: long accurate reads UL reads: ultra-long reads 问题， 重复序列压缩后，如何恢复成原来的序列 Methods
后续于 服务器推荐
2 Methods 2.2 Algorithm Overview SPAdes 构建组装图和contig 规范化顶点和边的正反向 深入的利用 pair-end read 之间额外的连接信息 利用contig，pair-end links 和 coverage 信息进行分割分支和收缩无分支路径，来解开
Methods Methods overview. 算法流程 有一个参考的基因组集合。 这个集合选出可能用来指导样本组装的子集，一个基因组，它内部的marker gene 在样本的reads中越多，越优先被选择。 基于ANI 核苷酸一致性，对参考序列集合聚类去冗余 组装中，以cluster为单位进行
Abstract 介绍分箱是什么，做这篇工作的原因。本文的主要内容是什么，结果怎么样，最终的用途。 Introduction 介绍为什么需要分箱，微生物多样性未知，此外许多很难在实验室隔离培养。所以出现了 binning作为一个策列去探索未知的微生物社区。 介绍了几种binning的方法原理，然后几
Methods Simulating genome completeness and contamination NCBI 上 4978 个 bacterial 和 322 个archaeal，Galah去重（99%）。Prodigal预测基因，BBMap采样预测的蛋白质。创建完整度5-100%的片
看起来很美好，实际应用感觉一般啊，试了试 图上的对比学习，图运算限制太大了，而且实际效果也不太行。后续把 simCLR 改 MOCO 试试效果。 https://zhuanlan.zhihu.com/p/605750441 GNN 最好的介绍 https://distill.pub/2021/gnn
caddy 配置 xxx.com { encode gzip reverse_proxy localhost:1234 { header_up X-Forwarded-Host {host} header_up X-Real-IP {remote_host} header_up Ho
社区发现 louvain算法 1 Leiden算法 2 感觉和聚类算法很像。。。 聚类算法 <
负二项分布描述的是第r次成功之前失败的次数。 负二项分布与二项分布不一样，它表示在一些列伯努利试验中，成功概率为 p，成功次数为 r之前的失败次数的概率分布。表示成： x \sim NB(r,p) \\ P_r(x=k) = C_{k+r-1}^k(1-p)^kp^r Abstract Mettag
算法感觉有一个问题啊，他只在含有marker gene的contig里面选择增加新bin，但如果一个物种的genome里面没有marker基因呢，是不是没法作为一个bin出现了，可以考虑下contig graph的结构来看，距离近的且没有被添加到任何bin中的contigs 自己组成一个新bin。这
steam api 返回数据中游戏时长 游戏未开始前 { "appid": 582010, "name": "Monster Hunter: World", "playtime_forever": 21896, "img_icon_ur
MEC https://academic.oup.com/bioinformatics/article/21/10/2456/207527 找到一个最少的SNP变换操作(0->1,1->0)，将SNP片段分成两组，每组组内SNP不冲突（每个SNP位点上的SNP都是一样的），每组代表一个单倍型。 Ab
这篇文章用的数据感觉不错，比较完善可以留着之后用 LongTR is implemented as a C++ package and is accessible on GitHub (https://github.com/gymrek-lab/LongTR) [31]under GNU Gener
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媒体服务 jellyfin 免费开源，但有些视频文件读取不到，转码hdr时发白（好像下个版本修复），备用方案 version: '3.5' services: jellyfin: image: jellyfin/jellyfin:latest container_name: j
电源只接硬盘时，需将24针绿线和任意一个黑线短接，否则电源不会工作。 mini主机 型号： 火影mn56 配置 ：5700u 16g+512g 双m2接口（2280 + 2242） 价格：1394 外置硬盘柜 外壳 4盘位，带4个dell硬盘支架，可加装风扇，咸鱼3D打印 价格： 79 背板 蜗牛星
前提 有nat1，stun打洞能打通， 原理 在路由器上的设置为例 1. 通过stun打洞获得 路由器ip：端口a 和 公网ip：端口b（b是随机的）一对一映射， 2. 设置端口转发 路由器ip：端口a 到 主机ip：端口b 3. 设置qbitorrent传入端口为b
尽管登录URL以HTTPS开头，但轮询URL没有，你将无法登录，因为这可能是一个安全问题，请与管理员联系 config.php 内添加 'overwriteprotocol' => 'https',
alist + qbittorrent + aria2 docker-compose 配置 踩坑记录 开始用了 alist-aria2 image ，发现没有qbittorrent ，然后自己找了个qbittorrent docker结果alist死活连不上，最后发现，alist容器里访问local
Haplotype-resolved assembly of a tetraploid potato genome using long reads and low-depth offspring data Background 基于参考序列的单倍型组装方法 HapTreeand H-PoP 本文使
Introduction Polyploidy 多倍体：是拥有多余两个同源染色体的基因组，人、土豆、小麦、草莓分别有2、4、6、8个同源染色体 haplotypes 单倍型：是指生物体的一条染色体上来自于某一单亲的一组紧密相连的等位基因组合。 每个人有两条单倍型，分别来自双亲 dosage 剂量：描
依次选择 1 2 进入配置terminal 的 json页面
Category Name Core algorithms Similarity measures Databases Numbersa Cross-validat
1. Predicting circRNA-disease associations using similarity assessing graph convolution from multi-source information networks 利用多源信息网络的相似性评估图卷积预测环状RN
1. Kernel Risk Sensitive Loss-based Echo State Networks for Predicting 基于内核风险敏感损失的回波状态网络，用于通过稀疏学习预测治疗肽 2023.9.6 Abstract
概念 batch norm 对于某个神经元的特征值，根据一个batch所有样本在这个神经元位置的特征值均值方差归一化。 layer norm 对于单个样本某一层神经元的特征值，根据这层所有的特征值均值方差归一化 训练过程中，如果发现准确度波动较大或者异常，可以区看看梯度回传值的在多个层的变化是否有异
如果装有tf卡，拆机时一定一定一定！！！！要注意先把tf卡拿下来。 左右两侧肩键和扳机键手感不一样，搜了下
注意：python版本一定要用3.10.6 stable-diffusion 大模型生成图片 https://github.com/AUTOMATIC1111/stable-diffusion-webui 将别人ai生成的图片放到PNG info 可以得到他训练时的参数，可以直接导入 运行时最好加上
Pan-Peptide Meta Learning for T-cell receptor–antigen binding recognition Model-Agnostic Meta-Learning （MAML）模型介绍及算法详解 个人理解：其实把他看作正常的模型训练，它主要目的是能在小样本数
Deep learning-based prediction of the T cell receptor–antigen binding specificity 部分名词解释 HLA：Human Leukocyte Antigen ，人类白细胞抗原，是人类的主要组织相容性复合体（MHC）的表达产物
游戏排序随机 仁王2 时长 112h 地图非常阴间，各种地形杀，绕路，很容易迷路，还有各种地方藏着小怪然后突然蹦出来，比如头顶、地面、水里、房子拐角。画风感觉也一样，光污染严重，这个我感觉还是挺喜欢的。 一周目开局类似魂游戏，怪基本打你，到后期等级起来后加了阴阳术忍术，然后稍微弄点装备变无双游戏，可
运行 docker 启动 halo2 时命令 docker run \ -it -d \ --name halo2 \ -p 8091:8090 \ -v ~/.halo2:/root/.halo2 \ halohub/halo:2.3.0 \ --halo.external
安装umami 创建 docker-compose.yml 填入 --- version: '3' services: umami: image: ghcr.io/umami-software/umami:postgresql-latest ports: - "300
如果你看到了这一篇文章，那么证明你已经安装成功了，感谢使用 Halo 进行创作，希望能够使用愉快。
以管理员权限启动 powershell 敲下面命令即可：foreach ($n in (get-appxpackage).packagefamilyname) {checknetisolation loopbackexempt -a -n="$n"}如果只想对某个特定 UWP 应
个人服务器：Oracle ARM 64系统： ubuntu各种说明在wiki里面写的非常清楚，还有中文版下载运行https://github.com/JustArchiNET/ArchiSteamFarmRelease页面选择合适的下载链接，arm服务器选择arm版本的 https://github
2022.12.23 早上起来感觉嗓子有一点不适，没管，下午觉得头疼躺床上了，没吃药，下午大概五六点，中午吃的全吐出来了，然后又喝了一杯姜汤水，又全吐了，歇了一会后吃了一点东西，吃了布洛芬，量了量体温38.5，然后晚上11点又吃了一次药，这时体温37.2左右，2022.12.24 早上六七点，体温3
论文地址TandemMapperSelection of k-mersTandemMapper使用稀少的k-mer，即出现次数小于组装长度除以100kb的值。因为如果使用唯一的k-mer，它的密度可能会变化的特别明显，会导致某些区域的覆盖率下降或者不正确的映射。但由于长串联重复的组装可能会出错，一些
源地址 https://github.com/liaocp666/halo-theme-daisy修改内容：原来的首页改成个人主页将文章列表改成现在的主页重写文章归档页面把分类和标签合并到一起修复了分页的bug添加了文章快速编辑按钮添加指定图标移动端修复头像bug移动端添加搜索框和一些其他信息
model bias : 模型太过简单，不存在合适的参数来应该拟合所有数据判断是不是 model bias : 先使用一个比较小的网络，甚至是线性模型或者svm，来看看会得到什么样的loss。如果model的loss大于这些简单model的loss，这就是优化问题，不是model的问题。
Minimap and miniasm: fast mapping and de novo assembly for noisy long sequences 符号定义∑=A,C,G,T\sum = {A,C,G,T}∑=A,C,G,T 为核苷酸的字符表。对于 a∈∑a \in \suma∈∑，a‾
介绍断断续续玩了几个月，趁着端午假期（本来想回趟家的，打着打着忘了），终于打完了这部最终幻想7重制版，总共二十几个小时的流程。打完后，设定背景有的还没搞明白，去找了找解说，又看了几个小时。存档完结撒花 评价人物方面，蒂法直接完美，爱丽丝和杰西也很不错。另外神罗总裁儿子有点帅，尤其用枪的后坐
GAN由生成器和判别器 (D) 组成，生成器 (G) 负责生成样本，判别器负责判断生成器生成的样本是否为真目
文章http://genome.cshlp.org/content/27/5/747.full.pdf+html?sid=39918b0d-7a7d-4a12-b720-9238834902fd克隆git clone https://github.com/fxia22/HINGE.gitgit su
更新软件列表sudo apt updatesudo apt upgradeapt install docker.iocurl -1sLf 'https://dl.cloudsmith.io/public/caddy/stable/gpg.key' | sudo tee /etc/ap
甲骨文 + cloudflare 简直白嫖的神实测 油管4K秒开，解锁Netflix首先自己电脑要支持ipv6，否则会慢很多本地ipv6---cloudflare ipv6---甲骨文ipv6/ipv4
pipelineA：输入是长的高错误率的read，smrt（sms）B：过滤掉一些长度低于固定值的被标记为chimeric的readC：对repeat进行标记，通过能比对到这个read上的read数量的快速增加或者减少来确定。增加或减少存在于同一个read上的这种标记为 brideged repea
原始版本 https://b.mortal.live/archives/txtspider增加了线程池的多线程爬虫解决了部分网站上存在的文字混合的问题，把图片转化成文字from turtle import htfrom matplotlib.pyplot import textimport requ
鼠标移动点击自己设置好之后，可以用来做重复性的人物from time import sleepimport pyautogui,keyboard# 长按 ESC 退出，3s以上while True: if keyboard.is_pressed("esc"):
断断续续注册了半年时间，终于过了，开心。记录一下可能需要注意的点。信用卡如果是零额度的需要存新加坡币，验证的时候需要1.38，建议多放点决定是否成功的关键因素估计就是ip了，之间一直在学校注册失败，开代理也是失败，放假回家使用家用ip一次成功，如果使用公共ip注册失败，建议换家庭ip，
cpu主板内存条显卡硬盘固态硬盘机械硬盘电源散热机箱机箱风扇外设屏幕鼠标键盘音箱
没有代理可以设置proxies为空proxies={}import requestsfrom bs4 import BeautifulSoupimport reimport osimport timefrom lxml import etreeproxies={ 'http': 'http:/
服务器探针使用的源码地址- ServerStatus中文版- ServerStatus-HostLoc其中客户端和web主要在ServerStatus-HostLoc的基础上稍作修改，因为ServerStatus中文版中有月流量统计功能，所以使用它做服务端原理整个系统共包括三个部分：客户端服务器we
git clone https://github.com/PacificBiosciences/pbdagcon.gitcd pbdagcon修改 makefile中25行， cd blasr_libcpp; NOHDF=1 NOPBBAM=1 python2.7 configure.py查看自己
WSL 设置代理，使用外部windows的代理cat /etc/resolv.conf 查看 DNS 服务器 IP。可以看到 DNS 服务器 172.20.176.1 ，通过ALL_PROXY设置代理，export ALL_PROXY="http://172.20.176.1:10809&
204. 计数质数暴力筛选法，对所有数进行标记，对于一个质数，他所有的倍数都不是质数。class Solution {public: int countPrimes(int n) { if(n<3) return 0; vector<int> re
Introduction最优化：在满足一系列约束条件下，获得目标函数或指标获得一个最大值（最小值）Linear programs（线性规划）线性函数 (linear function) $f(x) = a^T x$仿射函数 (affine function $f(x) = a^T x + β$所有线
349. 两个数组的交集首先记录下nums1中出现过的数字，如果nums2中也出现就将其加入到集合中。class Solution {public: vector<int> intersection(vector<int>& nums1, vector<i
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测试环境：Visual Studio Community 2019作用域有四种不同类型的作用域----文件作用域，函数作用域，代码块作用域和原型作用域。代码块作用域：位于一对花括号之间的所有语句称为一个代码块，代码块开始声明的具有~。文件作用域：任何在所有代码块之外声明的标识符都有~。原型作用域：只